MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG100

Total Repeats: 685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006389	GCC	2	6	35	40	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_006389	ACTGGC	2	12	61	72	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006389	CAA	2	6	109	114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006389	ACT	2	6	166	171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376108
5	NC_006389	T	6	6	213	218	0 %	100 %	0 %	0 %	55376108
6	NC_006389	TAG	2	6	228	233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376108
7	NC_006389	ATT	2	6	246	251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376108
8	NC_006389	CTGAG	2	10	256	265	20 %	20 %	40 %	20 %	55376108
9	NC_006389	GAT	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376108
10	NC_006389	GAA	2	6	321	326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376108
11	NC_006389	GTT	2	6	398	403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376108
12	NC_006389	TTC	2	6	426	431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376108
13	NC_006389	GAA	2	6	581	586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376108
14	NC_006389	CTG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376108
15	NC_006389	AGC	2	6	686	691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376108
16	NC_006389	TCG	2	6	786	791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376108
17	NC_006389	GAA	2	6	798	803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376108
18	NC_006389	TCT	2	6	855	860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376109
19	NC_006389	CACC	2	8	871	878	25 %	0 %	0 %	75 %	55376109
20	NC_006389	AAC	2	6	954	959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376109
21	NC_006389	CCA	2	6	981	986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376109
22	NC_006389	CGC	2	6	1011	1016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376109
23	NC_006389	CGA	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376109
24	NC_006389	GTCTG	2	10	1197	1206	0 %	40 %	40 %	20 %	55376109
25	NC_006389	CGC	2	6	1215	1220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376109
26	NC_006389	GGCA	2	8	1276	1283	25 %	0 %	50 %	25 %	55376109
27	NC_006389	TGG	2	6	1295	1300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376109
28	NC_006389	AC	3	6	1387	1392	50 %	0 %	0 %	50 %	55376109
29	NC_006389	GTGG	2	8	1409	1416	0 %	25 %	75 %	0 %	55376109
30	NC_006389	TC	3	6	1438	1443	0 %	50 %	0 %	50 %	55376109
31	NC_006389	GTGTC	2	10	1477	1486	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_006389	GGA	2	6	1531	1536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006389	CGT	2	6	1540	1545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006389	GCAG	2	8	1597	1604	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_006389	CGT	2	6	1630	1635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006389	CGA	2	6	1726	1731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_006389	CGA	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_006389	CAA	2	6	1879	1884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_006389	TCG	2	6	1887	1892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006389	CTC	2	6	1978	1983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376110
41	NC_006389	CTT	2	6	2268	2273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006389	CTT	2	6	2344	2349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006389	AG	3	6	2350	2355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006389	GGA	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006389	CTG	2	6	2503	2508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_006389	CTT	2	6	2514	2519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_006389	GTC	2	6	2626	2631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_006389	GCT	2	6	2649	2654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006389	TCA	2	6	2660	2665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006389	AT	3	6	2708	2713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006389	TTGA	2	8	2725	2732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006389	AG	3	6	2806	2811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006389	CCG	2	6	2857	2862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_006389	GTC	2	6	2893	2898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_006389	GACCG	2	10	2975	2984	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_006389	TCC	2	6	2990	2995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_006389	T	6	6	3133	3138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006389	GTA	2	6	3188	3193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006389	CT	3	6	3225	3230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_006389	AGT	2	6	3234	3239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006389	TGG	2	6	3272	3277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006389	GGC	2	6	3366	3371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006389	GTC	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_006389	CCT	2	6	3385	3390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_006389	GA	3	6	3401	3406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006389	CAG	2	6	3428	3433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_006389	GAA	2	6	3595	3600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006389	GTC	2	6	3605	3610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_006389	ATCG	2	8	3688	3695	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_006389	AT	3	6	3717	3722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006389	AAT	2	6	3735	3740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006389	CTGG	2	8	3768	3775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_006389	TG	3	6	3796	3801	0 %	50 %	50 %	0 %	55376111
74	NC_006389	CGT	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376111
75	NC_006389	GTA	2	6	3878	3883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376111
76	NC_006389	CTCG	2	8	3940	3947	0 %	25 %	25 %	50 %	55376111
77	NC_006389	TCA	2	6	3954	3959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376111
78	NC_006389	CGA	2	6	3973	3978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376111
79	NC_006389	TCT	2	6	4038	4043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376111
80	NC_006389	TCA	2	6	4062	4067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006389	ACA	2	6	4260	4265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376112
82	NC_006389	AT	3	6	4284	4289	50 %	50 %	0 %	0 %	55376112
83	NC_006389	TCA	3	9	4311	4319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376112
84	NC_006389	TCG	2	6	4446	4451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376112
85	NC_006389	GGGCC	2	10	4468	4477	0 %	0 %	60 %	40 %	55376112
86	NC_006389	TCG	2	6	4506	4511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376112
87	NC_006389	GAA	2	6	4573	4578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376112
88	NC_006389	GCA	2	6	4665	4670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376112
89	NC_006389	TC	3	6	4679	4684	0 %	50 %	0 %	50 %	55376112
90	NC_006389	CTCC	2	8	4792	4799	0 %	25 %	0 %	75 %	55376112
91	NC_006389	GTT	2	6	4814	4819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376112
92	NC_006389	ATC	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376112
93	NC_006389	AAT	2	6	4873	4878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006389	AG	3	6	4907	4912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006389	GAT	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006389	CCCG	2	8	5123	5130	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_006389	CAAA	2	8	5155	5162	75 %	0 %	0 %	25 %	55376113
98	NC_006389	GGA	2	6	5166	5171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376113
99	NC_006389	CAAGCA	2	12	5253	5264	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	55376113
100	NC_006389	TAC	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376113
101	NC_006389	TGA	2	6	5346	5351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376113
102	NC_006389	AGA	2	6	5466	5471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376113
103	NC_006389	CAT	2	6	5491	5496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376113
104	NC_006389	AGC	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376113
105	NC_006389	CT	3	6	5557	5562	0 %	50 %	0 %	50 %	55376113
106	NC_006389	GTC	2	6	5583	5588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376113
107	NC_006389	GGA	2	6	5625	5630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376113
108	NC_006389	CTG	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_006389	TC	3	6	5712	5717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_006389	CGG	2	6	5748	5753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_006389	TGC	2	6	5757	5762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_006389	AGAT	2	8	5782	5789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006389	AGT	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006389	AGC	2	6	5839	5844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_006389	CT	3	6	5861	5866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_006389	TTG	2	6	5874	5879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006389	TAA	2	6	5892	5897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006389	GT	3	6	5952	5957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006389	GAT	2	6	5970	5975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006389	GGC	2	6	5984	5989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006389	AAC	2	6	6013	6018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376114
122	NC_006389	GAA	2	6	6042	6047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376114
123	NC_006389	TCC	2	6	6089	6094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376114
124	NC_006389	TCG	2	6	6181	6186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376114
125	NC_006389	CGC	2	6	6232	6237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376114
126	NC_006389	GAA	2	6	6324	6329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376114
127	NC_006389	GAA	2	6	6402	6407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006389	GTT	2	6	6424	6429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006389	C	6	6	6502	6507	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
130	NC_006389	CGC	2	6	6509	6514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_006389	ACG	2	6	6603	6608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_006389	GCC	2	6	6612	6617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_006389	CTCG	2	8	6649	6656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_006389	CGT	2	6	6674	6679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_006389	CAG	2	6	6758	6763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_006389	CCG	2	6	6772	6777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_006389	AAAC	2	8	6881	6888	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_006389	TCGT	2	8	6902	6909	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_006389	GTC	2	6	6935	6940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_006389	GAC	2	6	6978	6983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_006389	AAT	2	6	6985	6990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006389	GTC	2	6	7045	7050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376115
143	NC_006389	GCT	2	6	7100	7105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376115
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147	NC_006389	CTG	2	6	7362	7367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376115
148	NC_006389	CAG	2	6	7401	7406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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174	NC_006389	TAC	2	6	8726	8731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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272	NC_006389	GGT	2	6	14039	14044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
273	NC_006389	TCG	2	6	14129	14134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_006389	AGAA	2	8	14214	14221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
275	NC_006389	CAC	2	6	14222	14227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
276	NC_006389	TCG	2	6	14233	14238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_006389	GCC	2	6	14262	14267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
278	NC_006389	CA	3	6	14270	14275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
279	NC_006389	TCT	2	6	14432	14437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_006389	CT	3	6	14442	14447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
281	NC_006389	GCA	2	6	14630	14635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376124
282	NC_006389	GCC	2	6	14637	14642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376124
283	NC_006389	CGA	2	6	14654	14659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376124
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287	NC_006389	GAG	2	6	14841	14846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376124
288	NC_006389	ACGGCG	2	12	14869	14880	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376124
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290	NC_006389	CGG	2	6	14971	14976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_006389	GGAA	2	8	15047	15054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
292	NC_006389	TGA	2	6	15091	15096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376125
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297	NC_006389	ACA	2	6	15371	15376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_006389	TAG	2	6	15391	15396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
299	NC_006389	TGCG	2	8	15454	15461	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
300	NC_006389	CAC	2	6	15524	15529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
301	NC_006389	AG	3	6	15802	15807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
302	NC_006389	TC	3	6	15837	15842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
303	NC_006389	CGA	2	6	15851	15856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_006389	CGGAC	2	10	15925	15934	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
305	NC_006389	AGCA	2	8	15970	15977	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
306	NC_006389	ACA	2	6	15983	15988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
307	NC_006389	G	7	7	16034	16040	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
308	NC_006389	TGA	2	6	16044	16049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
309	NC_006389	TG	3	6	16059	16064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
310	NC_006389	GTT	2	6	16074	16079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
311	NC_006389	ACT	2	6	16117	16122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
312	NC_006389	CCT	2	6	16222	16227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376126
313	NC_006389	CA	3	6	16375	16380	50 %	0 %	0 %	50 %	55376126
314	NC_006389	GTG	2	6	16410	16415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376126
315	NC_006389	TCG	2	6	16479	16484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376126
316	NC_006389	GCT	2	6	16495	16500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376126
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340	NC_006389	TAAGAC	2	12	17504	17515	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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359	NC_006389	AG	3	6	18571	18576	50 %	0 %	50 %	0 %	55376128
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375	NC_006389	AAG	2	6	19308	19313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
376	NC_006389	AGA	2	6	19316	19321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
377	NC_006389	GT	3	6	19379	19384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
378	NC_006389	CT	3	6	19385	19390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
379	NC_006389	TGTAG	2	10	19409	19418	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_006389	TCC	2	6	19466	19471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
382	NC_006389	GT	5	10	19508	19517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
383	NC_006389	GCT	2	6	19577	19582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
384	NC_006389	TGT	2	6	19654	19659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
385	NC_006389	GTCA	2	8	19717	19724	25 %	25 %	25 %	25 %	55376130
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393	NC_006389	TTG	3	9	19844	19852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376130
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398	NC_006389	GC	3	6	20031	20036	0 %	0 %	50 %	50 %	55376130
399	NC_006389	ATG	2	6	20132	20137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376130
400	NC_006389	CAA	2	6	20172	20177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376130
401	NC_006389	GAT	2	6	20179	20184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376130
402	NC_006389	CTG	2	6	20185	20190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376130
403	NC_006389	CGAA	2	8	20286	20293	50 %	0 %	25 %	25 %	55376130
404	NC_006389	GTTC	2	8	20300	20307	0 %	50 %	25 %	25 %	55376130
405	NC_006389	CAGAT	2	10	20342	20351	40 %	20 %	20 %	20 %	55376130
406	NC_006389	GA	3	6	20354	20359	50 %	0 %	50 %	0 %	55376130
407	NC_006389	TGA	2	6	20400	20405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376130
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410	NC_006389	TCT	2	6	20472	20477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376130
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